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个人简介 Personal Profile 吴秋博士，主要研究方向为发展单细胞、空间功能基因组学技术及计算方法，研究免疫疾病、衰老等复杂生物系统中疾病相关细胞类型的分化、功能及致病机制，鉴定疾病相关关键基因。近五年来，相关成果以共同第一/共同通讯作者发表在Cell Stem Cell、Nucleic Acids Research等国际著名学术期刊上。获得上海市超级博士后、国家自然科学基金青年项目、博士后面上项目等支持。 研究方向Research Directions 功能基因组学,表观遗传学,生物信息学 2. 机电结构优化与控制 研究内容：在对机电结构进行分析和优化的基础上，运用控制理论进行结构参数的调整，使结构性能满足设计要求。1. 仿生结构材料拓扑优化设计, 仿生机械设计 研究内容：以仿生结构为研究对象，运用连续体结构拓扑优化设计理论和方法，对多相仿生结构(机构)材料进行2. 机电结构优化与控制 研究内容：在对机电结构进行分析和优化的基础上，运用控制理论进行结构参数的调整，使结构性能满足设计要求。1. 仿生结构材料拓扑优化设计, 仿生机械设计 研究内容：以仿生结构为研究对象，运用连续体结构拓扑优化设计理论和方法，对多相仿生结构(机构)材料进行整体布局设计。 整体布局设计。 报考意向 招生信息 生命科学与技术学院 硕士研究生 序号 专业 招生人数 年份 1 生物学 1 2024 报考意向 姓名: 手机号码： 邮箱： 毕业院校： 所学专业： 报考类型： 博士 硕士 个人简历*： 上传附件 支持扩展名：.rar .zip .doc .docx .pdf .jpg .png .jpeg 成绩单*： 上传附件 支持扩展名：.rar .zip .doc .docx .pdf .jpg .png .jpeg 其他材料： 上传附件 支持扩展名：.rar .zip .doc .docx .pdf .jpg .png .jpeg 备注： 提交 科研项目 主持国家自然科学基金青年项目、上海市超级博士后及博士后面上项目。 研究成果 1.Xu R*, Li S*, Wu Q*, Li C*, Jiang M*, Guo L, Chen M, Yang L, Dong X, Wang H, Wang C#, Liu X#, Ou X#, Gao S#. Stage-specific H3K9me3 occupancy ensures retrotransposon silencing in human pre-implantation embryos. Cell Stem Cell 2022; 29(7):1051-1066. (Cover story)2.Sun D, Liu Z, Li T, Wu Q#, Wang C#. STRIDE: accurately decomposing and integrating spatial transcriptomics using single-cell RNA sequencing. Nucleic Acids Res 2022; 50(7):e42-e423. Mei S*, Qin Q*, Wu Q*, Sun H, Zhen R, Zang C, Zhu M, Wu J, Shi X, Taing L, Liu T, Brown M, Meyer CA#, Liu XS#. Cistrome Data Browser: a data portal for ChIP-Seq and chromatin accessibility data in human and mouse. Nucleic Acids Res 2016; 45(D1):D658-D662.4.Qin Q*, Mei S*, Wu Q*, Sun H, Li L, Taing L, Chen S, Li F, Liu T, Zang C, Xu H, Chen Y, Meyer CA, Zhang Y, Brown M, Long HW#, Liu XS#. ChiLin: a comprehensive ChIP-seq and DNase-seq quality control and analysis pipeline. BMC Bioinformatics 2016; 17(1):404.5.Han T*, Wang X*, Shi S, Zhang W, Wang J, Wu Q, Li Z, Fu J, Zheng R, Zhang J, Tang Q, Zhang P#, Wang C#. Cancer Cells Resistance to IFN-γ via Enhanced Double-Strand Break Repair Pathway. Cancer Immunol Res 2023; 11(3):381–398.6.Wang C*, Chen C*, Liu X*, Li C*, Wu Q, Chen X, Yang L, Kou X, Zhao Y, Wang H, Gao Y#, Zhang Y#, Gao S#. Dynamic nucleosome organization after fertilization reveals regulatory factors for mouse zygotic genome activation. Cell Res 2022; 32(9):801-813.7.Qin Q*, Fan J*, Zheng R, Wan C, Mei S, Wu Q, Sun H, Brown M, Zhang J#, Meyer CA#, Liu XS#. Lisa: inferring transcriptional regulators through integrative modeling of public chromatin accessibility and ChIP-seq data. Genome biol 2020; 21(1):1-14.8.Zheng R*, Wan C*, Mei S, Qin Q, Wu Q, Sun H, Chen CH, Brown M, Zhang XY#, Meyer CA#, Liu XS#. Cistrome Data Browser: expanded datasets and new tools for gene regulatory analysis. Nucleic Acids Res 2019; 47 (D1):D729-D735.9.Xiao T*, Li W*, Wang X, Xu H, Yang J, Wu Q, Huang Y, Geradts J, Jiang P, Fei T, Chi D, Zang C, Liao Q, Rennhack J, Andrechek E, Li N, Detre S, Dowsett M, Jeselsohn R, Liu X#, Myles B#. Estrogen-regulated feedback loop limits the efficacy of estrogen receptor–targeted breast cancer therapy. PNAS 2018; 115(31):7869-7878.10. Mei S*, Meyer CA*, Zheng R, Qin Q, Wu Q, Jiang P, Li B, Shi X, Wang B, Fan J, Brown M, Zang C#, Liu XS#. Cistrome Cancer: a web resource for integrative gene regulation modeling in cancer. Cancer Res 2017; 77(21):e19-e22.11. Fei T*, Chen Y*, Xiao T, Li W, Cato L, Zhang P, Cotter MB, Bowden M, Lis RT, Zhao SG, Wu Q, Feng FY, Loda M, He HH, Liu XS#, Brown M#. Genome-wide CRISPR screen identifies HNRNPL as a prostate cancer dependency regulating RNA splicing. PNAS 2017; 114(26):E5207-E5215.12.Wang S*, Zang C*, Xiao T, Fan J, Mei S, Qin Q, Wu Q, Li XJ, Xu K, He HH, Brown M, Meyer CA#, Liu XS#. Modeling cis-regulation with a compendium of genome-wide histone H3K27ac profiles. Genome Res 2016; 26(10):1417-1429.13.Xu H*, Xiao T*, Chen CH, Meyer CA, Wu Q, Wu D, Cong L, Zhang F, Liu JS, Brown M#, Liu XS#. Sequence determinants of improved CRISPR sgRNA design. Genome Res 2015; 25(8):1147-57. 学生信息 当前位置：教师主页 > 学生信息 入学日期 所学专业 学号 学位 招生信息 当前位置：教师主页 > 招生信息 招生学院 招生专业 研究方向 招生人数 推免人数 考试方式 招生类别 招生年份