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更新日期：2020年2月14日 姓 名 凌飞 性 别 女 出生年月 1972年10月 籍贯 广西桂平 民 族 壮族 政治面貌 中国共产党党员 最后学历 最后学位 理学博士 技术职称 教授 导师类别 博、硕导 行政职务 Email fling@scut.edu.cn 工作单位 生物学院 邮政编码 510006 通讯地址 广东省广州市番禺区大学城华南理工大学生物学院 单位电话 020-39380601 个人简介 近5年已发表SCI论文30余篇（第一作者或通讯作者身份发表SCI文章21篇，总影响因子95，单篇引用131次）。第一或通讯作者论文在Nature Biotechnology、PROCEEDINGS OF THE ROYAL SOCIETY B-BIOLOGICAL SCIENCES（Top期刊）、Genetics（Top期刊），Scientific reports、virology、PLoS One、Tissue antigen、American journal of Primatology、Immunogenetics、human immunology、Molecular Biology Report、DNA and Cell Biology、Molecular and cell biochemistry、Biochemical and Biophysical Research Communications等杂志发表。一篇开拓性文章《食蟹猴与中国恒河猴两种非人灵长类动物模型的基因组测序与比较》于2011年在《Nature Biotechnology》（影响因子43）在线发表。该重大成果的取得实现了华南理工大学生物学院教师问鼎自然系列杂志零的突破。在此基础上，本人在美国华盛顿大学留学期间，在领域内顶尖团队Josh Akey团队，通过灵长类动物基因组MHC区域DHSs比较、进化分析及结合GWAS数据库发现，除了宿主与病原体互作以及繁殖适应外，大脑发育与认知能力也在驱动人类MHC的进化，并从因果关系挖掘和证实了MHC的已有和潜在全新的功能。回国后，在国内率先开展灵长类动物的DHS研究，聚焦宿主与病毒进化军备竞赛，首次从分子进化学角度阐述了灵长类动物TRIM家族76个潜在的抗病毒基因的调控区变异（DNA酶Ⅰ超敏感位点）如何应对长期进化过程中病毒的选择，发现并提出了灵长类动物基因组调控区变异与其抗病毒能力差异的进化机制。研究成果于2016年发表于SCI Top期刊Proceedings of the Royal Society B（《英国皇家学会会志B辑-生物科学》）上。 工作经历 1995-1996年，海南椰风集团，团支书，主要工作内容：宣传；1996-1997年，海南保亭县保亭中学，中级教师，主要工作内容：教学；1997-2001年，海南琼州大学，讲师，主要工作内容：教学、指导本科生毕业；2004-2005年，华南农业大学，科研助理；2008-2011年，华南理工大学，博士后，主要工作内容：科研；2011-2017年，华南理工大学，先上岗研究员、教授，主要工作内容：教学、科研、指导本科生与研究生。 教育经历 1991-1995年，中山大学生命科学学院，动物学专业，学士学位；1999-2000年，华南师范大学生命科学院，进修生物化学与分子生物学研究生课程；2004、2008年，华南农业大学动物分子遗传专业，硕士、博士学位。2008-2010年，华南理工大学生物科学与工程学院，博士后研究。2013-2014年，美国华盛顿大学医学院基因组科学系，Josh Akey课题组，进化基因组研究。 社会、学会及学术兼职 广东省免疫学会会员、广东省实验动物学会会员 研究领域 主要研究领域是动物分子遗传学、比较基因组与进化基因组学、免疫遗传学，目前主要研究方向是：1）利用生物信息学、进化基因组学、基因组编辑技术，研究灵长类动物基因组调控区的变异与进化，如抗病毒TRIM家族，大脑发育相关基因、生殖相关基因等，与抗病毒、大脑疾病和繁殖障碍等疾病表型的关系。2）利用scRNA-seq和scDNase-seq等最新单细胞组学方法，研究肿瘤免疫微环境T细胞的作用。亦对肿瘤免疫微环境中B细胞的作用感兴趣，如何与T细胞互作，是否与T细胞的衰竭有关？在肿瘤免疫微环境中扮演什么重要角色？在肿瘤的转移和逃逸以及免疫抑制中的关键作用是什么？3）利用单细胞组学、基因组编辑及人全能干细胞技术，研究退行性疾病发病机理及干细胞靶向治疗 科研项目 1. 广州市科学研究一般项目： 201804010318，结直肠癌免疫微环境单细胞转录组研究，2018.01-2020.12 ；2. 广东省科技计划项目（广东省科技厅），2015A030302010，HIV-2感染中国恒河猴艾滋病模型建立，2015/05-2017/04.3. 广东普通高校省级重大科研项目，2014KZDXM009，印度恒河猴与食蟹猴六种细胞全基因组DHSs分析与比较，2015/01-2017/12.4. 华南理工大学校级项目（中央高校基本科研业务费重点项目），2014ZG0017，脂质体介导hTERT构建MHC遗传背景清晰的猕猴永生化DC方法的建立，2014/01-2015/12.5. 华大-华工创新基因项目，非人灵长类哺乳动物SD比较研究，2013/08-2015/08.6. 国家自然科学基金面上项目，31271322，食蟹猴与中国恒河猴TRIM5α不同等位基因限制HIV-2复制的作用机理研究，2013/01-2016/12.7. 国家科技支撑一级课题（中国科学院亚热带农业生态研究所），2012BAD19B02，南方农作区鼠害防控技术研发与示范，2012/01-2016/12.8. 华南理工大学校级项目（中央高校基本科研业务费重点项目），2012ZZ0093，食蟹猴TRIM5及MHC基因与HIV-2易感性的分子机理研究，2012/01-2013/12.9. 广东省自然科学基金博士启动项目（广东省科技厅），S2011040005261，食蟹猴MHC等位基因多态性与SIV易感性遗传机理研究，2011/10-2013/09.10. 科技开发项目 [横向项目（中国农科院植保所）]，雄性褐家鼠减数分裂相关基因在不同环境条件下的表达调控机制分析，2011/01-2012/12.11. 国家自然科学基金重点项目（国基重点），41330639，金属矿区硫素生物地球化学循环过程中的关键科学问题研究，2013/08-2018.（项目核心骨干参加） 发表论文 以下是近5年发表的代表性论文：1. Yangmei Yan§, Guojie Zhang§, Xiaodong Fang§, Yanfeng Zhang§, Cai Li§, Fei Ling§, David N Cooper, Qiye Li, Yan Li, Alain J van Gool, Hongli Du, Jiesi Chen, Ronghua Chen, Pei Zhang, Zhiyong Huang, John R Thompson, Yuhuan Meng, Yinqi Bai, Jufang Wang, Min Zhuo, Tao Wang, Ying Huang, Liqiong Wei, Jianwen Li, Zhiwen Wang, Haofu Hu, Pengcheng Yang, Liang Le, Peter D Stenson, Bo Li, Xiaoming Liu, Edward V Ball, Na An, Quanfei Huang, Yong Zhang, Wei Fan, Xiuqing Zhang, Yingrui Li, Wen Wang, Michael G Katze, Bing Su, Rasmus Nielsen, Huanming Yang, Jun Wang, Xiaoning Wang* & Jian Wang*. Genome sequencing and comparison of two non-human primate animal models, cynomolgus monkey and the Chinese rhesus macaque. Nature Biotechnology, 2011, 29(11): 1019-1023  (co-first author) （§同等贡献） (if:43)2. Jin Y, Gittelman RM, Lu Y, Liu X, Li MD, Ling F, Akey JM. Evolution of DNAase I Hypersensitive Sites in MHC Regulatory Regions of Primates. Genetics. 2018 Jun;209(2):579-589. doi: 10.1534/genetics.118.301028. Epub 2018 Apr 18. (通讯作者）二区，Top期刊(if:4.556)3. He DD, Lu Y, Gittelman R, Jin Y, Ling F, Joshua A. Positive selection of the TRIM family regulatory region in primate genomes. Proc Biol Sci. 2016 Oct 12;283(1840). pii: 20161602 (通讯作者）二区，Top期刊(if:4.9)4. Su Z, Zhang J, Kumar C, Molony C, Lu H, Chen R, Stone DJ, Ling F, Liu X. Species-specific exome probes reveal new insights in positively selected genes in nonhuman primates. Sci Rep. 2016 Sep 23;6:33876. doi: 10.1038/srep33876. (共同通讯作者）二区(if:5.228)5. Hui-Ling Zhang, Feng-Liang Liu, Ya-Bin Jin, Qing Deng, Bei-Lei Liu, Min Zhuo, Xiao-Hui liu, Yong-Tang Zheng, Fei Ling. The effects of TRIM5α polymorphism on HIV-2ROD and SIVmac239 replication in PBMCs from Chinese rhesus macaques and Vietnamese-origin cynomolgus macaques. Virology, Volume 487, January 2016, Pages 222–229 (通讯作者）(if:3.2)6. He DD, Mao ShL, Wang W, Jin YB, Zhang HL, Ling F. SAMHD1 Polymorphisms were Significantly Correlated with HIV/SIV Virus Load in PBMC from Chinese Rhesus Macaques and Cynomolgus Macaques. Curr HIV Res. 2017;15(1):15-22. doi: 10.2174/1570162X14666161018144926. (通讯作者）7. W. Wang, D.-D. He, S.-L. Mao, M. Zhuo, F. Ling. Ten novel MHC class II alleles identified in cynomolgus macaques of Vietnamese origin. Tissue Antigens HLA. 2016 Feb;87(2):115-6. doi: 10.1111/tan.12731. Epub 2016 Jan 13 (通讯作者）8. Chen M, Song P, Zou D, Hu X, Zhao S, Gao S, Ling F. Comparison of multiple displacement amplification (MDA) and multiple annealing and looping-based amplification cycles (MALBAC) in single-cell sequencing. PLoS One. 2014 Dec 8;9(12)(通讯作者)9. Wang W, Lu YE, Zhuo M, Ling F. Identification of five novel MHC class II alleles in cynomolgus macaques of Vietnamese origin. HLA. 2016 Jul;88(1-2):61-2. doi: 10.1111/tan.12840. Epub 2016 Jul 8(通讯作者)10. Liu B, Jin Y, Lu Y, Wu Y, Xue Y, Zhang Y, Liu Y, Zhuo M, Ling F. Comprehensive identification of high-frequency and combination MHC-DMA and -DMB alleles in a cohort of Chinese rhesus macaques and cynomolgus macaques of Vietnamese origin. Hum Immunol. 2015 Mar;76(2-3):109-12.(通讯作者)11. Zhang H, Deng Q, Jin Y, Liu B, Zhuo M, Ling F. Comprehensive identification of MHC class II alleles in a cohort of Chinese rhesus macaques. Immunogenetics. 2014 Oct; 66(9-10):575-80. doi: 10.1007/s00251-014-0789-y. Epub 2014 Jul 22 (通讯作者)12. Xiang R, Zhang H, Deng Q, Yue R, Tang H, Zhang Y, Ling F, Zhuo M, Du H, Xu S, Xu Q, Wang X. Comprehensive identification of high-frequency and co-occurring Mafa-DPA1, Mafa-DQA1, Mafa-DRA, and Mafa-DOA alleles in Vietnamese cynomolgus macaques. Immunogenetics. 2013 Sep;65(9):667-74. (通讯作者） 13. Zhang G, Qiu W, Xiang R, Ling F, Zhuo M, Du H, Wang J, Wang X. TRIM5a Polymorphism Identification in Cynomolgus Macaques of Vietnamese Origin and Chinese Rhesus Macaques. Am J Primatol. 2013 Sep;75(9):938-46. (通讯作者） 14. Qing Deng , Huiling Zhang , Ruirui Xiang, Zhenwu Zhang , Fei Ling, Min Zhuo & Hongli Du & Xiaoning Wang. Identification of Mamu-DPA1, -DQA1, and -DRA alleles in a cohort of Chinese rhesus macaques. Immunogenetics. 2013 65:901–904 (通讯作者） 15. Fei Ling, Min Zhuo, Chao Ni, Gui-qing Zhang, Tao Wang, Li-qiong Wei, Hong-li Du, Ju-fang Wang, Xiao-ning Wang. Comprehensive identification of high-frequency and co-occurring Mafa-B, Mafa-DQB1 and Mafa-DRB alleles in cynomolgus macaques of Vietnamese origin. Hum Immunol. 2012 May;73(5):547-53. doi: 10.1016/j. 16. Ling F, Wei LQ, Wang T, Wang HB, Zhuo M, Du HL, Wang JF, Wang XN. Characterization of the major histocompatibility complex class II DOB, DPB1, and DQB1 alleles in cynomolgus macaques of Vietnamese origin. Immunogenetics. (2011) 63:155–166.17. Ling F, Wang T, Wei L, Zhu X, Chen Y, Li J, Zhang Z, Du H, Wang X, Wang J. Cloning and characterization of the 5'-flanking region of the pig AgRP gene. Mol Biol Rep. 2011 Apr;38(4):2233-9.18. Ling F, Wei L, Wang T, Chen Y, Zhu X, Li J, Liu T, Du H, Wang H, Wang J. Cloning and Characterization of the 5'-Flanking Region of the Pig Cocaine- and Amphetamine-Regulated Transcript Gene. DNA Cell Biol. 2011 Feb;30(2):91-7.19. H.-B. Wang§, F. Ling§, M. Zhuo, J. –F Wang, X. -N Wang. Twenty-three novel MHC class I B alleles identified in cynomolgus macaques of Vietnamese origin. Tissue Antigen, 2011,77, 341–348  (co- first author) （§同等贡献）20. Ling F, Fang W, Chen Y, Li J, Liu X, Wang L, Zhang H, Chen S, Mei Y, Du H, Wang C. Identification of novel transcripts from the porcine MYL1 gene and initial characterization of its promoters . Mol Cell Biochem. 2010 Oct;343(1-2):239-4721. Fei Ling, Jiaqi Li, Yaosheng Chen, Hongli Du, Yingjie Mei, Delin Mo, Chong Wang. Cloning and characterization of the 5′-flanking region of the pig adiponectin gene. Biochemical and Biophysical Research Communications, 2009 Apr 3;381(2):236-40. 教学活动 主讲本科生物技术班《普通生物学》、《分子遗传学》、《分子生物学》三门专业课。 指导学生情况 指导13名研究生和15名同等学历研究生，多人次获得国家奖学金，其中张慧玲同学获得广东省优秀研究生称号。 我的团队 隶属生物学院院长合成生物学团队下的大数据及组学研究小组。