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个人经历 personal experience 教育经历 2008 - 2020 哈尔滨工业大学本部 计算机科学与技术学院 计算机应用技术专业  学士-硕士-博士，师从王亚东教授2017 - 2018 美国哈佛大学 博士研究员(Predoctoral Research Fellow)2015 - 2017 美国哈佛大学 博士联培(Visiting Scholar)，师从哈佛大学Clemens Scherzer 教授!!!招生NEWS 2024.02.22!!！可招收考研学生1名，报名从速。

教育教学

综合介绍 General Introduction 汪涛，博士，现任西北工业大学计算机学院副教授，研究生导师，中国计算机学会生物信息专委会委员、中国生物工程学会计算与生信专委会委员。哈尔滨工业大学计算机科学与技术专业本硕博，美国哈佛大学联合培养博士，曾就职哈佛医学院生物信息学方向博士生研究员。1）学术业绩：发表SCI以及计算机领域高水平会议论文30余篇，其中以第一/通讯作者在生物信息学领域知名期刊会议等发表论文17篇；合作论文发表在Nature Neuroscience、Nature Communications等期刊。以第一作者申请国家发明专利8项，授权1项。2）科研奖励：2022.03，入选西安市科协青年人才托举计划（排名1/1）；2023.04，荣获陕西省高等学校科学技术研究优秀成果奖一等奖（排名3/5）。3）人才培养：作为指导教师，荣获中国大学生计算机设计大赛国家级二等奖、中国大学生计算机设计大赛西北地区一等奖、大学生“互联网+”创新创业项目获校级三等奖，指导本科生获创新创业项目6项，指导本科生获校级优秀毕业设计；获批1项教育部产学合作协同育人项目“面向‘人工智能生物医学大数据’的多学科交叉人才培养模式探索与实践”。4）学术兼职：2021.09至今，中国计算机学会生物信息专委会委员2022.07至今，中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会委员2023.08至今，SSCI期刊Frontiers in Psychiatry副主编2021.12至今，生物本体与知识库学术论坛共同主席2021.01至今，SCI期刊Applied Sciences-Basel、Frontiers in Psychology、Frontiers in Genetics、Frontiers in Oncology客座编委2022- 2023，第十六届、十七届国际生物信息学和生物医学会议（IEEE BIBM）程序委员2023，第十六届前沿计算机理论与工程国际会议（ICACTE）程序主席和分论坛主席2022，第十五届前沿计算机理论与工程国际会议（ICACTE）技术委员2022，第四届计算机大数据与人工智能国际会议（ICCBDAI）分论坛主席2022，第二届计算与人工智能国际会议（ISCAI）技术委员此外，担任Briefings in Bioinformatics、Briefings in Functional Genomics、PLOS Computational Biology、BMC Bioinformatics、Frontiers in Psychiatry、Frontiers in Genetics、Connection Science、NAR Genomics and Bioinformatics、IEEE BIBM等SCI期刊/会议审稿人，担任国家自然科学基金函评专家。欢迎计算机、数学、物理、生命科学等相关学科本科生、硕士生、博士生加入团队课题组或进行科研合作！课题组长期招聘 博士后，待遇从优，欢迎与我联系！ 个人相册

荣誉获奖

科学研究 Scientific Research Research Interests: Bioinformatics, Machine learning, Network modeling, Deep Learning, Big Data MiningSelected Publication:[24] Wang, Tao+, Zhihao Yan+, Yiming Zhang+, Zhuofei Lou+, Xiaozhu Zheng+, Duoduo Mai, Yongtian Wang, Xuequn Shang, Bing Xiao, Jiajie Peng, Jing Chen*. "postGWAS: A Web Server for Deciphering the Causality post the Genome-wide Association Studies." Computers in Biology and Medicine (2024). (Accepted, SCI 一区, IF = 7.7)[23] Wang, Tao*+,  Hui Zhao+, Yungang Xu, Yongtian Wang, Xuequn Shang*, Jiajie Peng*, Bing Xiao*. "scMultiGAN: Cell-Specific Imputation for Single-Cell Transcriptomes with Multiple Deep Generative Adversarial Networks." Briefings in Bioinformatics (2023). (SCI一区，IF = 13.9)[22] Dong X, Bai Y, Liao Z, Gritsch D, Liu X, Wang T, Borges-Monroy R, Ehrlich A, Serrano GE, Feany MB, Beach TG. "Circular RNAs in the human brain are tailored to neuron identity and neuropsychiatric disease." Nature Communications. 2023 Sep 18;14(1):5327.[21] Wang, Yongtian, Xinmeng Liu, Yewei Shen, Xuerui Song, Tao Wang, Xuequn Shang, Jiajie Peng*. "Collaborative deep learning improves disease-related circRNA prediction based on multi-source functional information" Briefings in Bioinformatics (2023). (SCI一区，IF = 13.9)[20] Wang, Tao*, Miguel E. Rentería*, Zhen Tian*, and Jiajie Peng*. "Data mining and statistical methods for knowledge discovery in diseases based on multimodal omics, volume II." Frontiers in Genetics 14 (2023).[19] Wang, Tao, Jinjin Yang, Yifu Xiao, Jingru Wang, Yuxian Wang, Xi Zeng, Yongtian Wang, and Jiajie Peng. ''DFinder: A novel end-to-end graph embedding-based method to identify drug-food interactions." Bioinformatics 39, no. 1 (2023): btac837. (SCI 一区，IF = 6.931)[18] Wang, Tao, Hui Zhao, Yifu Xiao, Hanzi Yang, Xipeng Yin, Yongtian Wang, Bing Xiao, Xuequn Shang, and Jiajie Peng. "Discovering eQTL Regulatory Patterns Through eQTLMotif." in 2022 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM).  (CCF B类会议)[17] Wang, Tao, Hengbo Xu, Ranye Zhang, Yifu Xiao, Jiajie Peng, and Xuequn Shang. "Hypergraph-based Gene Ontology Embedding for Disease Gene Prediction." in 2022 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). (CCF B类会议)[16] Chen, Jing, Pengfei Zhu, and Tao Wang*. "Exploring genetic mechanisms underlying EEG endophenotypes via summary-data-based Mendelian randomization." in 2022 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). (CCF B类会议)[15] Wang, Wei, Ruijiang Han, Menghan Zhang, Yuxian Wang, Tao Wang, Yongtian Wang, Xuequn Shang, and Jiajie Peng.A network-based method for brain disease gene prediction by integrating brain connectome and molecular network. Briefings in Bioinformatics (2022). (SCI一区，IF = 11.6)[14] Zhen, C., Wang, Y., Geng, J., Han, L., Li, J., Peng, J., Wang, T., Hao, J., Shang, X., Wei, Z. , Zhu, P., and J. Peng. A review and performance evaluation of clustering frameworks for single-cell Hi-C data. Briefings in Bioinformatics (2022). (SCI一区，IF = 11.6)[13] Wang, Tao, Miguel E. Rentería and Jiajie Peng. "Editorial: Data Mining and Statistical Methods for Knowledge Discovery in Diseases Based on Multimodal Omics." Frontiers in Genetics (2022)[12] Wang, Tao, Zhiyuan Shao, Yifu Xiao, Xuchao Zhang, Yitian Chen, Binze Shi, Siyu Chen, Yuxian Wang, Jiajie Peng*, and Xuequn Shang*. "Predicting Hepatoma-Related Genes Based on Representation Learning of PPI network and Gene Ontology Annotations." in 2021 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). (CCF B类会议)[11] Wang, Tao, Yongzhuang Liu, Quanwei Yin, Jiaquan Geng, Jin Chen, Xipeng Yin, Yongtian Wang, Xuequn Shang, Chunwei Tian, Yadong Wang and Jiajie Peng. "Enhancing discoveries of molecular QTL studies with small sample size using summary statistic imputation." Briefings in Bioinformatics (2021). (一区，IF = 13.9, ESI)[10] Wang, Tao, Junpeng Ruan, Xianjun Dong, Yadong Wang and Jiajie Peng. "A pipeline for RNA-seq based eQTL analysis with automated quality control procedures." BMC bioinformatics (2021). ( 二区，IF =3.2, ESI)[9] Wang, Tao, Qidi Peng, Bo Liu, Yongzhuang Liu and Yadong Wang. "Disease module identification based on representation learning of complex networks integrated from GWAS, eQTL summaries and human interactome." Frontiers in Bioengineering and Biotechnology 8 (2020): 418.[8] Wang, Tao, Qidi Peng, Bo Liu, Xiaoli Liu, Yongzhuang Liu, Jiajie Peng, and Yadong Wang. "eQTLMAPT: fast and accurate eQTL mediation analysis with efficient permutation testing approaches." Frontiers in Genetics 10 (2019): 1309.[7] Wang, Tao, Junpeng Ruan, Quanwei Yin, Xianjun Dong, and Yadong Wang. "An automated quality control pipeline for eQTL analysis with RNA-seq data." In 2019 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), pp. 1780-1786. IEEE, 2019.[6] Wang, Tao, Jiajie Peng, Qidi Peng, Yadong Wang, and Jin Chen. “FSM: Fast and Scalable Network Motif Discovery for Exploring Higher-order Network Organizations.” Methods, 2019. Doi: 10.1016/j.ymeth.2019.07.008.[5] Peng, Jiajie, Guilin Lu, Hansheng Xue, Tao Wang, and Xuequn Shang. "TS-GOEA: a web tool for tissue-specific gene set enrichment analysis based on gene ontology." BMC bioinformatics 20, no. 18 (2019): 572.[4] Dong, X., Liao, Z., Gritsch, D., Hadzhiev, Y., Bai, Y., Locascio, J.J., Guennewig, B., Liu, G., Blauwendraat, C., Wang, T. and Adler, C.H., 2018. Enhancers active in dopamine neurons are a primary link between genetic variation and neuropsychiatric disease. Nature neuroscience, 21(10), pp.1482-1492.[3] Wang, Tao, Jiajie Peng, Yadong Wang, and Jin Chen. “Identifying Representative Network Motifs for Inferring Higher-order Structure of Biological Networks.” In 2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), pp. 149-156. IEEE, 2018.[2] Peng, Jiajie^, Tao Wang^, Jianping Hu, Yadong Wang, and Jin Chen. "Constructing networks of organelle functional modules in Arabidopsis." Current genomics 17, no. 5 (2016): 427-438. (^ represents co-first authorship)[1] Peng, Jiajie, Tao Wang, Jixuan Wang, Yadong Wang, and Jin Chen. "Extending gene ontology with gene association networks." Bioinformatics 32, no. 8 (2016): 1185-1194.

科学研究

学术成果 Academic Achievements 科研项目：主持，国家自然科学基金青年科学基金项目主持，中国博士后科学基金面上项目主持，中央高校基本科研业务费参与，科技部重点研发项目子课题人才项目：主持，2022年西安市科协青年人才托举项目

学术成果

团队信息 Team Information 2024.01: 祝贺团队成员闫志豪（研二）、买朵朵（研三）、项目成员张一鸣（本科毕设）、楼卓飞（本科毕设），以及所有其他合作者，在生物信息知名期刊Computers in Biology and Medicine (中科院一区, IF = 7.7) 投稿文章被接收！祝贺！2023.10: 祝贺团队成员赵辉（研三）以及所有其他合作作者，在生物信息顶级期刊Briefings in Bioinformatics (中科院一区, IF = 13.9) 投稿文章被接收！祝贺！2023.08: 邀请哈佛大学董献军助理教授来校讲座交流，欢迎！2023.08: 祝贺与哈佛大学合作学术成果被国际顶级期刊Nature Communications接收！2023.07: 祝贺本科生徐珩博、张然也获中国大学生计算机设计大赛国家二等奖（国家级）！祝贺！2023.06: 祝贺7位本科毕设同学顺利毕业！（舒涵-直博、章煦超-保研、金禹孜-出国深造、舒秋豪-保研、楼卓飞-读研、张一鸣-读研、范海鹏-工作）2023.05: 祝贺本科生徐珩博、张然也获中国大学生计算机设计大赛西北赛区一等奖（国家级）！祝贺！2022.12: 祝贺团队成员杨金金（研三）、团队成员肖翼甫（研三）以及所有其他合作作者，在生物信息顶级期刊Bioinformatics (中科院一区, IF = 6.931) 投稿文章被接收！祝贺！2022.11: 祝贺团队成员赵辉（研二）、团队成员肖翼甫（研三）以及所有其他合作作者，在IEEE BIBM （CCF B类会议）投稿文章被接收！祝贺！2022.11: 祝贺团队成员朱鹏飞（研一）以及所有其他合作作者，在IEEE BIBM （CCF B类会议）投稿文章被接收！祝贺！2022.11: 祝贺项目成员徐珩博（计算机学院本科生）、张然也（计算机学院本科生），团队成员肖翼甫（研三）以及所有其他合作作者，在IEEE BIBM （CCF B类会议）投稿文章被接收！祝贺！2022.09: 祝贺王思琪同学即将前往香港大学攻读研究生，祝一切顺利！2022.06: 祝贺王思琪同学获得西北工业大学“优秀本科毕业设计”！2021.11: 祝贺项目成员邵致远（教育实验学院大三）、陈逸天（教育实验学院大三）、章煦超（教育实验学院大二）、史彬泽（教育实验学院大二）、陈思宇（教育实验学院大二），团队成员肖翼甫（计算机学院研二）以及所有其他合作作者，在IEEE BIBM （CCF B类会议）投稿文章被接收！祝贺！2021.09: 祝贺项目成员尹泉伟（计算机学院本科生）和耿嘉泉（计算机学院研一）以及所有其他合作作者，在生物信息顶级期刊Briefings in Bioinformatics (中科院一区, IF = 11.6) 投稿文章被接收！祝贺！2021.04: 祝贺项目成员阮俊鹏（计算机学院本科生）以及所有其他合作作者，在生物信息知名期刊BMC Bioinformatics (中科院二区, IF = 3.2) 投稿文章被接收！祝贺！

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