杨剑教师主页

个人简介 Personal Profile 杨剑，男，研究员，博士生导师。2004年获得中国科学院生物物理研究所理学博士学位。长期在国内从事微生物基因组学相关的生物信息学研究，重点聚焦于病原细菌毒力因子的遗传多样性特征研究。自主设计构建了目前国际上最大的病原细菌毒力因子数据平台，得到国内外学术同行的高度认可和广泛应用。在此基础上，近年来利用新兴的深度学习技术开发了全球首个综合性的细菌毒力因子分类卷积神经网络模型，并通过微生物基因组大数据挖掘，揭示了多种毒力因子的物种分布、进化分型和毒力结构域等特征，通过生物信息学数据挖掘推动了细菌致病机制的相关研究。先后主持承担国家自然科学基金、国家973计划、国家重点研发计划等多项科研项目。近年来作为第一或通讯作者（含并列）发表SCI论文30篇（H指数19），被同行引用超过3600次（https://www.webofscience.com/wos/author/rid/A-3031-2009）。其中三篇论文位列ESI高被引论文，并有一篇入选“2019年中国百篇最具影响国际学术论文”。2019、2020和2022年度指导的三名博士研究生均获得“北京市优秀毕业生”荣誉称号。2009年入选北京市科技新星计划（A类），2016年获得中华医学科技奖二等奖（排名第三）和“北京协和医学院优秀教师”称号，2017年受聘为中国医学科学院/北京协和医学院第七届学术委员会委员。